香港铁路有限公司（港铁公司）旗下多个港铁站、轻铁站和大型商场位于屯门警区，故此屯门警区一直与港铁公司保持紧密的伙伴关系，以加强双方于港铁铁路网络处理突发事故的应变能力及预防罪案的协作。

二〇二〇年十二月十五日，屯门警区在新界北总区冲锋队的协助下，联同消防处和港铁公司在区内轻铁车厂举行联合演习，加强彼此沟通及处理突发事故的应变能力。演习模拟一名怀疑精神紊乱人士于一辆行驶中的轻铁列车中引爆一个卡式石油气罐，导致多人受伤。各部门人员透过沟通和协调成功拯救伤者，警队人员亦迅速进行扫荡并拘捕疑犯。

二〇二一年一月五日，屯门警区邀请了港铁公司企业保安主管与车务经理（轻铁及巴士）会面，交流防止罪案的经验。双方讨论了近期港铁铁路网络和商场的罪案和相关防罪措施，例如如何加强保安以防止恶意入侵及破坏，亦商讨了未来的合作计划，包括设立直接沟通渠道以加强情报交流，并安排屯门警区人员向港铁公司员工作经验分享。